Guillaume RIVIERE
Professeur
PHARE
CAMPUS I, CAEN
guillaume.riviere@unicaen.fr
+33 2 31 56 51 13

Thèmes de recherche

Régulation épigénétique et épigénomique fonctionnelle du développement et de la reproduction.chez un invertébré marin : comprendre l’évolution des mécanismes épigénétiques.

Comment ont évolué la régulation épigénétique, ses mécanismes moléculaires et leur signification biologique?

Comment le développement d’organismes dans un environnement changeant, qui influence l’expression des gènes et la structure de la chromatine, est-il aussi reproductible ?

Quel est le rôle des modifications chimiques du nucléosome dans l’établissement transitoire de transcriptimes spécifiques et dans la différenciation cellulaire?

Quel est le rôle de la méthylation de l’ARN (m6A) dans la régulation épitranscriptomique du développement et la transmission de traits de vie ?

Pour participer à répondre à ces question, j’essaye de comprendre le rôle de la méthylation de l’ADN, la méthylation de l’ARN, et plus généralement des modifications chimiques du nucléosome et leurs régulateurs , au cours du développement et de la reproduction d’un modèle distant, l’huître Crassostrea gigas. Mes activités de recherche s’attachent à comprendre et décrire les mécanismes épigénétiques intervenant dans la régulation de l’expression des gènes/de la structure de la chromatine lors de la différenciation cellulaire. Pour cela je m’intéresse au développement de l’embryon, ainsi qu’à la reproduction (notamment chez les huîtres triploïdes), des processus qui mettent en oeuvre une forte différenciation cellulaire dans un contexte d’exposition/sensibilité différente aux paramètres environnementaux . Pour ces travaux, j’utilise principalement des approches moléculaires, cellulaires et biochimiques, dont des méthodologies à haut débit (MeDIP/MeRIP/BS-seq) et développe des études fonctionnelles (CRISPR/Cas).

Enseignements et diffusions des connaissances

Biologie animale, épigénétique, biologie cellulaire, biologie du développement, évolution.

Responsabilités administratives

Co-responsable Licence Sciences de la Vie 3e année parcours Biologie et Physiologie des Organismes

Co-responsable Recherche master Aquacaen M2

 

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Article dans une revue

2024

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Favrel, P., Dubos, M., Bernay, B., Pasquier, J., Schwartz, J., Lefranc, B., Mouret, L., Rivière, G., Leprince, J., & Bondon, A. (2024, Jan). Structural and functional characterization of an egg-laying hormone signaling system in a lophotrochozoan -- The pacific oyster (Crassostrea gigas). General and Comparative Endocrinology, 346, 114417. <10.1016/j.ygcen.2023.114417>. <hal-04571008>.
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Sol Dourdin, T., Guyomard, K., Rabiller, M., Houssais, N., Cormier, A., Le Monier, P., Sussarellu, R., & Rivière, G. (2024, Jan). Ancestors’ Gift: Parental Early Exposure to the Environmentally Realistic Pesticide Mixture Drives Offspring Phenotype in a Larger Extent Than Direct Exposure in the Pacific Oyster, Crassostrea gigas. Environmental Science and Technology, 58 (4), 1865-1876. <10.1021/acs.est.3c08201>. <hal-04571012>.

2023

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Le Franc, L., Petton, B., Favrel, P., & Rivière, G. (2023, Aug). Profiling of N6-methyladenosine dynamics indicates regulation of oyster development by m6A-RNA epitranscriptomes. Genomics, Proteomics and Bioinformatics, 742-755. <10.1101/2021.08.30.458180>. <hal-03331890>.
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Sol Dourdin, T., Rivière, G., Cormier, A., Di Poi, C., Guyomard, K., Rabiller, M., Akcha, F., Bah Thierno, S., Le Monier, P., & Sussarellu, R. (2023, Jun). Molecular and phenotypic effects of early exposure to an environmentally relevant pesticide mixture in the Pacific oyster, Crassostrea gigas.. Environmental Pollution (1970), 326, 121472. <10.1016/j.envpol.2023.121472>. <hal-04101505>.

2021

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Le Franc, L., Bernay, B., Petton, B., Since, M., Favrel, P., & Rivière, G. (2021, Mar). A functional m 6 A-RNA methylation pathway in the oyster Crassostrea gigas assumes epitranscriptomic regulation of lophotrochozoan development. FEBS Journal, 288 (5), 1696-1711. <10.1111/febs.15500>. <hal-02952460>. PDF
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Réalis-doyelle, E., Schwartz, J., Cabau, C., Le Franc, L., Bernay, B., Rivière, G., Klopp, C., & Favrel, P. (2021). Transcriptome Profiling of the Pacific Oyster Crassostrea gigas Visceral Ganglia over a Reproduction Cycle Identifies Novel Regulatory Peptides. Marine drugs, 19 (8), 452. <10.3390/md19080452>. <hal-03330324>. PDF

2019

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Cherif-feildel, M., Berthelin, C.H., Rivière, G., Favrel, P., & Kellner, K. (2019, Feb). Data for evolutive analysis of insulin related peptides in bilaterian species. Data in Brief, 22, 546-550. <10.1016/j.dib.2018.12.050>. <hal-02143349>.
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Cherif-feildel, M., Heude Berthelin, C., Adeline, B., Favrel, P., Kellner, K., & Rivière, G. (2019, Jan). Molecular evolution and functional characterisation of insulin related peptides in molluscs: Contributions of Crassostrea gigas genomic and transcriptomic-wide screening. General and Comparative Endocrinology, 271, 15-29. <10.1016/j.ygcen.2018.10.019>. <hal-02142617>.
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Fellous, A., Le Franc, L., Jouaux, A., Goux, D., Favrel, P., & Rivière, G. (2019, Sep). Histone Methylation Participates in Gene Expression Control during the Early Development of the Pacific Oyster Crassostrea gigas. Genes, 10 (9), 695. <10.3390/genes10090695>. <hal-04571004>. PDF

2018

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Sussarellu, R., Lebreton, M., Rouxel, J., Akcha, F., & Rivière, G. (2018, Mar). Copper induces expression and methylation changes of early development genes in Crassostrea gigas embryos. Aquatic Toxicology, 196, 70-78. <10.1016/j.aquatox.2018.01.001>. <hal-02155835>.

2017

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Rivière, G., He, Y., Tecchio, S., Crowell, E., Gras, M., Sourdaine, P., Guo, X., & Favrel, P. (2017, Jun). Dynamics of DNA methylomes underlie oyster development. PLoS Genetics, 13 (6), e1006807. <10.1371/journal.pgen.1006807>. <hal-02153935>. PDF

2015

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Fellous, A., Favrel, P., & Rivière, G. (2015, Feb). Temperature influences histone methylation and mRNA expression of the Jmj-C histone-demethylase orthologues during the early development of the oyster Crassostrea gigas. Marine Genomics, 19, 23-30. <10.1016/j.margen.2014.09.002>. <hal-04570998>.
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Riviere, G., Klopp, C., Ibouniyamine, N., Huvet, A., Boudry, P., & Favrel, P. (2015, Dec). GigaTON: an extensive publicly searchable database providing a new reference transcriptome in the pacific oyster Crassostrea gigas. BMC Bioinformatics, 16, 401. <10.1186/s12859-015-0833-4>. <hal-01258440>. PDF
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Saint-carlier, E., & Rivière, G. (2015, Jun). Regulation of Hox orthologues in the oyster Crassostrea gigas evidences a functional role for promoter DNA methylation in an invertebrate. FEBS Letters, 589 (13), 1459-1466. <10.1016/j.febslet.2015.04.043>. <hal-02155834>.

2014

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Rivière, G. (2014). Epigenetic features in the oyster Crassostrea gigas suggestive of functionally relevant promoter DNA methylation in invertebrates. Frontiers in Physiology, 5, 129. <10.3389/fphys.2014.00129>. <hal-01324608>. PDF
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Rivière, G., Lienhard, D., Andrieu, T., Vieau, D., Frey, B., & Frey, F. (2014, Oct). Epigenetic regulation of somatic angiotensin-converting enzyme by DNA methylation and histone acetylation. Epigenetics, 6 (4), 478-489. <10.4161/epi.6.4.14961>. <hal-04570995>.

2013

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Riviere, G., Wu, G.-C., Fellous, A., Goux, D., Sourdaine, P., & Favrel, P. (2013, Dec). DNA Methylation Is Crucial for the Early Development in the Oyster C. gigas. Marine Biotechnology, 15 (6), 739-753. <10.1007/s10126-013-9523-2>. <hal-02296498>.

2012

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Dheilly, N.M., Lelong, C., Huvet, A., Kellner, K., Dubos, M.-P., Riviere, G., Boudry, P., & Favrel, P. (2012). Gametogenesis in the Pacific oyster Crassostrea gigas: a microarrays-based analysis identifies sex and stage specific genes.. PLoS ONE, 7 (5), e36353. <10.1371/journal.pone.0036353>. <hal-00788261>.
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Dheilly, N.M., Lelong, C., Huvet, A., Kellner, K., Dubos, M.-P., Riviere, G., Boudry, P., & Favrel, P. (2012). Gametogenesis in the Pacific oyster Crassostrea gigas: a microarrays-based analysis identifies sex and stage specific genes.. PLoS ONE, 7 (5), e36353. <10.1371/journal.pone.0036353>. <hal-03779132>.

2011

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Rivière, G., Fellous, A., Franco, A., Bernay, B., & Favrel, P. (2011, Dec). A Crucial Role in Fertility for the Oyster Angiotensin-Converting Enzyme Orthologue CgACE. PLoS ONE, 6 (12), e27833. <10.1371/journal.pone.0027833>. <hal-04570992>.

2010

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Rivière, G. (2010, Feb). L'enzyme de conversion de l'angiotensine : une protéase conservée au cours de l'évolution. Journal de la Société de Biologie, 203 (4), 281-293. <10.1051/jbio/2009032>. <hal-04570988>.

2009

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Breton, C., Lukaszewski, M.-A., Risold, P.-Y., Enache, M., Guillemot, J., Rivière, G., Delahaye, F., Lesage, J., Dutriez-casteloot, I., Laborie, C., & Vieau, D. (2009, Mar). Maternal prenatal undernutrition alters the response of POMC neurons to energy status variation in adult male rat offspring. AJP - Endocrinology and Metabolism, 296 (3), E462-E472. <10.1152/ajpendo.90740.2008>. <hal-04570982>.

2007

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Rivière, G., Michaud, A., Corradi, H.R., Sturrock, E.D., Ravi Acharya, K., Cogez, V., Bohin, J.-P., Vieau, D., & Corvol, P. (2007, Sep). Characterization of the first angiotensin-converting like enzyme in bacteria: Ancestor ACE is already active.. Gene, 399 (1), 81-90. <10.1016/j.gene.2007.05.010>. <hal-00169226>.

2006

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Kapel, R., Chabeau, A., Lesage, J., Rivière, G., Ravallecple, R., Lecouturier, D., Wartelle, M., Guillochon, D., & Dhulster, P. (2006). Production, in continuous enzymatic membrane reactor, of an anti-hypertensive hydrolysate from an industrial alfalfa white protein concentrate exhibiting ACE inhibitory and opioid activities. Food Chemistry, 98 (1), 120-126. <10.1016/j.foodchem.2005.05.062>. <hal-04570973>.

2005

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Levoye, A., Mouillac, B., Rivière, G., Vieau, D., Salzet, M., & Breton, C. (2005, Jan). Cloning, expression and pharmacological characterization of a vasopressin-related receptor in an annelid, the leech Theromyzon tessulatum. Journal of Endocrinology, 184 (1), 277-289. <10.1677/joe.1.05833>. <hal-04570965>.
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Rivière, G., Michaud, A., Breton, C., Vancamp, G., Laborie, C., Enache, M., Lesage, J., Deloof, S., Corvol, P., & Vieau, D. (2005). Angiotensin-Converting Enzyme 2 (ACE2) and ACE Activities Display Tissue-Specific Sensitivity to Undernutrition-Programmed Hypertension in the Adult Rat. Hypertension, 46 (5), 1169-1174. <10.1161/01.HYP.0000185148.27901.fe>. <hal-04570919>.

2004

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Rivière, G., Michaud, A., Deloffre, L., Vandenbulcke, F., Levoye, A., Breton, C., Corvol, P., Salzet, M., & Vieau, D. (2004, Aug). Characterization of the first non-insect invertebrate functional angiotensin-converting enzyme: leech TtACE resembles the N-domain of mammalian ACE. Biochemical Journal, 382 (2), 565-573. <10.1042/BJ20040522>. <hal-04570950>.

Communication dans un congrès

2024

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Sol Dourdin, T., Rivière, G., & Sussarellu, R. (2024). Parental early exposure to environmentally realistic pesticide mixture drives offspring phenotype in a larger extent than direct exposure in the Pacific oyster. Paper presented at the PRIMO, Nantes, France. <hal-04807318>.

2022

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Sol Dourdin, T., Rivière, G., & Sussarellu, R. (2022). Phenotypic and molecular effects of early exposure to environmentally relevant pesticide mixture in the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Paper presented at the PRIMO, Gothenburg, Sweden. <hal-04807334>.
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Sol Dourdin, T., Rivière, G., & Sussarellu, R. (2022). Multigenerational Effects of Early Exposure to an Environmentally Relevant Pesticide Mixture in the Pacific Oyster, C. gigas.. Paper presented at the EPIMAR, Woods Hole, Massachusetts, United States. <hal-04807327>.

2021

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Sol Dourdin, T., Rivière, G., & Sussarellu, R. (2021). Embryo larval effects of early exposure to environmentaly realistic pesticides mixture in the pacific oyster, Crassostrea gigas. Paper presented at the PHYSIOMAR, Nelson, New Zealand. <hal-04807347>.